三加一专升本和自考有着截然不同的特点。在管理机构上，自考由各级自考办公室负责，而专升本则由各大院校承担。此外，证书颁发机构也不一样，自考的证书由高等教育自学考试委员会颁发，而专升本则由院校颁发。学制上也存在差异，专升本有规定的学制，而自考则没有学制限制。入学和毕业方式也不相同，专升本需要参加专升本考试来入学，并且一般毕业没有问题，而自考则需要逐科进行考试，所有科目合格后方能毕业。
自考是一种注重学历考试的高等教育国家考试，融合了个人自学、社会助学和国家考试的形式，是我国高等教育体系中重要的组成部分。而专升本指的是由具备本科办学资格的高校招生，针对大专毕业生进行考试或自学考试，录取为本科生。这种招生方式在大学毕业证书上没有特别标识，与统招本科生的求职、升学和工资待遇没有任何差别。
除了上述区别，自考本科和专升本还在毕业证和报名条件方面存在差异。自考本科的毕业证上会注明自考，但这并不影响其在职场和升学方面与全日制本科生平等对待。而专升本的毕业证则与普通本科毕业证没有区别。在报名条件上，专升本仅接受统招专科大三学生报考，并且只能选择与专科学习相关的本科专业，还有一定的地域限制。而自考本科对年龄、学历、种族、民族、居住地、身体健康等都没有特殊要求，报考门槛相对较低。
学习方式也是自考本科和专升本的另一差异所在。自考本科的学习方式非常灵活多样，提供了夜大、脱产学习、函授和网络教育等多种选择。这对于在职人员来说非常方便。而专升本只能选择在校学习模式，要进入所录取的本科院校，在校学习两年的时间与普通本科生无异。
最后，考取方式也有所不同。专升本需要通过入学考试，对语数英等基础学科进行考核，相当于第二次高考。只有达到一定标准的考生才能继续专升本学习。而自考本科则没有入学考试，考生可以集中精力进行本科阶段的学习。自考本科的考核方式相对简单，只需要参加单科考试，获得合格证书。所有科目合格后，便可申请毕业，并获得学历证书。
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