可以同时选择报考两个或多个专业，自学考试具有高度的灵活性和开放性，以满足不同文化程度和自学能力的考生的学习需求。
首先，考生可以选择报考不同层次的两个专业，比如同时报考自考专科和自考本科，这种方式被称为“专本套读”。在这种情况下，考生可以自由选择不同专业的组合，无需主要专科与本科专业相同。然而，需要注意的是，考生在完成自考本科前无法申请毕业，必须先获得一个国家承认的专科毕业证书。
其次，考生也可以选择报考同层次的两个专业。但是，在同时报考两个或多个专业时，考生应该根据自身实际情况合理安排学习时间和每次考试的课程门数，以免耽误了其他专业的学习。
选择专业时，考生应以兴趣为出发点，只有对感兴趣的东西才会积极学习。此外，考虑自身能力特点也是选择专业时要考虑的因素之一。还应该合理安排职业规划，明确目标并考虑社会需求和行业发展。此外，有些专业仅面向社会开放，而有些则仅限于在职人员报考。一些专业对报考者的学历和职业背景也有特定要求，特别是一些本科段和特殊专业。
自学考试不比全日制校内单科考试更轻松，甚至要更加严格。自考生大多是边工作边学习，他们可以根据自身的需求自由选择专业，因为他们对自己缺乏的知识有更深刻的了解，而且他们的社会适应能力和实践经验往往超过了普通的全日制学生。
最后，关于自学考试的毕业申请事项，考生需要按照专业考试计划逐步完成学业，并获得相应的合格成绩，并完成毕业论文或其他教学实践任务，通过思想品德鉴定。自学考试的毕业申请时间分为上半年（6月15~20日）和下半年（12月15~20日），逾期未申请的考生将不能申请本次毕业。办理毕业申请时，考生还需提供前学历的学历鉴定，并按照专业要求提供相关资格证书。
考生在获得毕业证书之后，毕业生考籍档案也是评定职称、工资调整以及工作变动的重要依据，因此需要妥善保管并及时交由所在单位人事部门管理。对于工作单位不固定的考生，可以将毕业生考籍档案交由人才交流中心代管。
