选择考试科目并非随心所欲，考生只能在每次考试公布的科目中挑选符合自己报考专业的科目。自学考试的公共课会每年至少安排两次，而专业基础课和专业课则每年至少有一次的安排。为了考虑到专业课程学习的规律性，每门课程的考试安排保持相对稳定。
然而，由于考试时间的有限性，在每个考试时间段内，难免会有课程安排上的重叠。因此，考生需要根据自身情况和课程考试的安排，科学地规划学习计划和备考准备。自学考试的课程可分为两类，即统考课程和省考课程。统考课程指的是全国范围内统一使用全国考办命题的课程，而省考课程则是指本省市范围内使用本地考委组织命题的课程。
自学考试的专业课程通常分为公共课、专业基础课、专业课和选修课。一般专科专业的考试科目不少于15门，总学分不低于70学分；而本科专业的理论考试科目门数不少于20门，总学分不低于125学分。值得一提的是，自学考试不设补考，考生只能参加下一轮次的考试。
自学考试的考试时间主要分为上半年和下半年两次，上半年的考试安排在四月下旬的第一个周六和周日，而下半年的考试安排则在十月下旬的第一个周六和周日。此外，目前还有一些省市也会在每年一月和七月安排一些课程的考试。
如果符合条件，考生可以申请免考。国家承认学历的各类高等学校以及自学考试专科及以上（包括专科）的毕业生、肄业生和退学生，可以免考与原所学课程相同或学分等于或低于原课程的课程。
